2025年6月18日，北京大学第三医院海淀北部院区（北医三院海淀北京院区）正式开诊，标志取海淀区北部医疗中心建设迈入新阶段。这次率先盛开门诊服务，蕴含20个临床科室，其中蕴含骨科、活动医学科等北医三院的热点科室。脊仫和住院服务凭据规划陆续启用。
北医三院海淀北部院区位于北京市海淀区六里屯南路6号院，占地面积9600余平方米，规划总床位400张。新院区由本院垂直治理，所有出诊专家均来自北医三院本部。院区建设先进的医疗设备，构建覆盖门（急）诊、检验查抄、住院、手术等多学科的综合诊疗系统，可能为各类疾病诊治和危机沉症救治提供了必要保险。同时，北医三院海淀北部院区对峙智慧化、人道化服务理想，将全面部署电子病历、移动支付、线上复诊等智慧医疗利用，深刻索求智慧院区建设。
内科系统科室12个：心血管内科、呼吸与危沉症医学科、内排泄科、肾内科、血液内科、消化科、老年内科、神经内科、皮肤科、中医科、肿瘤放疗科、全科医学科等。
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